2000年，蕉岭县辖12个镇：蕉城镇、兴福镇、新铺镇、高思镇、长潭镇、三圳镇、文福镇、广福镇、徐溪镇、蓝坊镇、南礤镇、北礤镇。
2002年，蕉岭县辖12个镇（蕉城、广福、文福、新铺、三圳、北礤、南礤、蓝坊、高思、兴福、徐溪、长潭），97个村委会、8个居委会。
截至2003年5月16日，蕉岭县辖10个镇（兴福、长潭、蓝坊、南礤、北礤、蕉城、广福、三圳、文福、新铺），共有9个居委会、97个村委会，1514个村民小组。面积975.1平方公里，人口22.53万。
2004年10月，蕉岭县撤销2个镇：兴福镇河东片的东山、湖谷、龙安、叟乐、高畲5个村委会并入蕉城镇，兴福镇河西片的堑垣、浒竹、上村、神岗4个村委会并入长潭镇；北礤镇并入南礤镇。
截至2005年12月31日，蕉岭县辖8个镇（蕉城镇、广福镇、文福镇、新铺镇、三圳镇、南礤镇、蓝坊镇、长潭镇）。
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