A、柠檬酸循环又称为三羧酸循环，因为第一个产物是柠檬酸故又称柠檬酸循环，在这个循环中琥珀酸脱氢酶位于内膜上，其他都在线粒体基质中，A正确；B、因为在循环过程中，只有琥珀酸脱氢酶位于内膜上，其他都在线粒体基质中，B错误；C、第三阶段在内膜上氧作为[H]的受体产生水，同时产生大量能量，C正确；D、有氧呼吸第二阶段在线粒体基质产生CO2，植物细胞在无氧呼吸时细胞基质也能产生CO2，D正确．故选：B．
