柱花草种子生产中虫害较少,主要是炭疽病[经鉴定有两个种型:胶孢炭疽病菌、菜豆炭疽病菌(Colletotrichum.lindermuthianum),每年都有发生。炭疽病的发生与天气有密切关系,阴雨天及台风会引起炭疽病大流行。1988年9~10月份,连续1个月出现阴雨天气,海南乐东种子场80%的格拉姆柱花草植株发病,其他种子场的格拉姆柱花草发病也很严重。因此,阴雨天气频繁时,对易感品种要及早喷0.2%多菌灵防病。喷药要从下风处开始,喷嘴与植株的垂直距离要在0.5米以上,以免引起药害。风速达5米/秒以上和降雨时不宜喷药。喷药一般在上午进行。在药液中加入农用增效剂,喷药后30分钟遇雨不必重喷,使用多菌灵胶乳配制药液,效果也很好。
近年又发现丛枝病,致病原因是类菌质体MLO。病株分枝丛状,叶子变小,严重时整株死亡。该病近年在乐东种子场发生较为严重,并有逐年加重的趋势,主要由叶蝉传播。由于柱花草种子田多年连作,叶蝉逐年繁殖增加,发病也逐年加重。当今还没有特效药物防治此病。发现病害要先杀灭昆虫,后拔除病株,堆积一起烧毁。提倡对柱花草种子田进行轮作,种1~2年柱花草后又改种其他非豆科作物。收完柱花草种子(一般当年12月至翌年2月收完)后还有几个月空余时间,有条件的地方最好种一茬瓜菜等短期经济作物,5月底前收获,接着进行种子田备耕。这样可以减少病虫害发生,又可改善种子田土壤养分状况,有利于柱花草生长,提高种子产量。同时,还可增加经济收入。