「君の名は」は古风な感じがします。Dramaticな雰囲気があり、物语のタイトルにぴったりです。「あなたの名前は」は普段使う言叶なので、すこし间が抜けたような。日本人がみたら、クスっと笑うと思います。
一个是口语一个是书面语
前者是平和的口气,后者是从上至下的口气。