1.自然灾害，由于环境的变迁，古印第安人几大文明地环境发生了变化，原适合耕种的地方干旱成了荒漠，迫使这些创造了辉煌文明的印第安人迁徙，文明逐步消失；
2.由于欧洲殖民统治，大量屠杀土著印第安人，加速了文明毁灭的进程，同时由于美洲与其它大陆不相连，有些病不在这里传播，殖民统治，也带去了本土居民从没有的病症（感冒），使得这一在世界其它地方为小病的疾病，成了土著人的致命病症，人口大量死亡；
3.当初欧洲人进入印第安世界时也受到了当地土著人的强烈反抗，印第安人远古时期是从亚洲迁徙过去的亚洲黄种人，原来有马，但后来灭种消失了，使得印第安人对“马”予以神话，欧洲入侵时重新带入了马，骑马作战，当地人以为神灵（据说欧洲人晚上睡觉只要在营地周围放几匹马，当地土著人就不敢进攻），所以很快印第安人的政权毁灭，少量印第安人退入雨林等原来人烟稀少的地方，印加文明终于被欧洲文明所取代。
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