如果手续齐全可以部分报销:第一、在北京就医时,需要在挂号告之是外地农村医疗合作保险,出院时要求医院出具诊断证明书、病例、费用明细。第二、带上上述材料与个人身份证、农村合作医疗本等到当地卫生部门提出报销请求,在经过审核后会对你在北京花费的部分费用给予报销。第三、在北京就医不需要农村合作医疗本,只需要告之是外地农村合作医疗就可以了。至于当地报销比例一般在一半左右,具体的要咨询你们当地医疗部门。