A、ATP分子由1个腺嘌呤核糖核苷酸和2个磷酸基团组成，A错误；B、3个ATP分子中含有6个高能磷酸键，B错误；C、ATP为直接能源物质，细胞中大多数需要能量的生命活动由ATP直接供能，C正确；D、叶绿体内光反应产生ATP，暗反应消耗ATP，故ATP的运输方向是类囊体薄膜→基质，D错误．故选：C．
