离子色谱仪测定的指标主要是阴离子，也有部分阳离子。阴离子：F-、Cl-、Br-、NO2-、PO43-、NO3-、SO42-以及甲酸、乙酸、草酸根离子等。也有部分阳离子，如Li+, Na+, NH4+, K+, Ca2+, Mg2+, Cu2+, Zn2+, Fe2+, Fe3+等。但是，金属浓度，如Li+、Na+、K+、Ca2+,、Mg2+、Cu2+、Zn2+、Fe2+、Fe3+等，多用原子吸收光谱仪测定。
