公园的地形依据中国地形的特点，由东向西逐级递高，公园由此而分为东、南、西、北四个大块。东块是原广中公园的自然式园林景区；南块是南国风情、湿地沼泽和河湖港汊景区；西区是西方园林精品和山林景区；北块是湖光山色和北海景区。东区以水为主，由湖堤景区、湖光山色景区、湖滨湿地景区组成；中区为沪上少见的沼泽园；西区为山林景区和欧式风情景区。
园内建有4公里长6米宽的环园道路，另辟2公里长4米宽的环湖小径围绕着面积约100亩，水深4米的大片湖面。黄浦江支流彭越浦河南北贯穿整个公园，把大宁灵石公园分成东、西、中三个园区。三个园区自然地形和景观风貌风格迥异。东块以水为主题，建有湖堤景区、湖光山色景区、湖滨湿地景区。中部为沼泽园。西部是山林景区和欧式风情景区。大宁灵石公园在东北、西北和南偏西处份别设东门、山门（也称西门）和水门。其东、西门前建有大型开敞式入口广场。
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