你选择的路线里面有些是不能用JRpass的,要重新安排行程。七日票是38880日元,看你图片里面的价格的话,JRpass是有优惠的,别忘了中间你也会座短程电车的。可以去JRpass官网查哪些铁路是可以用的,去yahoo搜JRパス,第一条就是。
往返京都到新宿:青春18 or 夜行巴士