原因如下：
黄色在中国古代有着非凡的意义，中国的人文初祖称为“皇帝”，华夏民族的发源地称为“黄土高原”，中国的母亲河称为“黄河”，黄色自古以来就赋予着特殊的含义。后来黄色更成为皇家专用色，皇帝穿的是“黄袍”，走的是“黄道”。
汉传佛教其实就是汉民族地区所传播的佛教教义，有些东西已经被汉化，佛法的传播很多是得到统治阶级的扶持，所谓“佛法东来为皇帝所重”，一开始的佛教其实就是“皇教”，所以寺庙建筑多为黄色，而在古代南方是正统的古汉人，所以南方地区保留下来的寺庙多为黄色。
藏传佛教多指西藏地区的宗教，古称“喇嘛教“。元朝建立后定都北京，崇尚藏密。藏区的寺庙一般由白、蓝、红组成，红色又有着吉祥的意思，蒙元的佛教多采用红色装饰。到了清朝时期，满清统治者当时就是联合了北方的蒙古族势力，对蒙古族所信仰的藏传佛教多有了解。
满清势力入关以后就靠着藏传密教来笼络蒙古族人心，随着满清势力向西拓展，藏传佛教也在北方慢慢传播开，这也导致北方很多寺庙的颜色是红色。
寺庙建筑中的特色----铜建筑
在中国寺庙建筑群中，有着很多铜建筑。追溯历史就会发现：
太和宫在云南昆明市郊鸣凤山上铜瓦寺内，为在铜瓦殿迁走后于康熙十年（1671年）在原址上补建。殿呈方形，殿内有神像、匾额、梁柱、墙隔等，这些均为铜铸。显通寺铜殿 在山西五台山显通寺内，殿内供一尊铜铸大佛和万尊小佛。此殿为中国现存最大的一座铜建筑。
殿前有一对铜塔，属覆钵、亭阁、楼阁等三种形式相结合的塔。武当山铜殿 坐落在湖北武当山主峰天柱峰顶端，为明永乐四十四年（1446年）建。金殿为铜铸鎏金，仿木构建筑。鸡足山铜殿 此殿原在云南昆明市郊鸣凤山铜瓦寺内，于明崇祯十年（1637年）移建到宾川鸡足山上。
宝云阁位于北京颐和园万寿山西坡，建于清乾隆二十年（1755年），仿木结构，通体呈蟹青色，坐落在汉白玉须弥座上。泰山铜亭 在山东泰山岱庙后院东侧，明万历四十三年（1615年）建于泰山顶碧霞祠，亭体为铜铸件，仿木结构。
峨眉华严铜塔 位于四川峨眉山麓报国寺内，是一座覆钵式与楼阁式相结合的塔，建于明万历年间，塔身满布浮雕，佛像、人物、狮、象等均突出于壁面，雕饰之富丽，在大型金属建筑中首屈一指。