A、叶绿体中将光能转化成稳定的化学能储存在有机物中.线粒体中把有机物中化学能转化成热能和ATP中的化学能.故A正确.B、叶绿体和线粒体都具有两层膜.线粒体内膜向内折叠形成嵴.故B正确.C、叶绿体基质中含有与光合作用有关的酶.线粒体基质中含有与呼吸作用有关的酶.故C正确.D、叶绿体以类囊体垛叠形成基粒增加膜面积,线粒体以内膜向内折叠形成嵴增加膜面积.故D错误.故选D.