为了进一步促进南京航空航天大学博士生的培养工作，提高博士学位的授予质量，南京航空航天大学研究生院先后出台了优秀博士、硕士学位论文评选及奖励办法，培育优秀博士学位论文试行办法以及关于博士学位论文隐名评审实施办法等，设立了博士学位论文创新与创优基金，制订了研究生“双语教学”课程建设计划实施意见，推动了我校研究生尤其是博士生培养质量的全面提高，学校已获全国优秀博士学位论文3篇，省优秀博士学位论文10篇，省优秀硕士学位论文25篇。
目前南京航空航天大学正根据国民经济建设和社会发展的需要，合理调整学科布局，优化学科结构，积极发展研究生教育，实施“以人为本，注重内涵，强化特色，加速发展，创建一流”的发展战略，为完成南京航空航天大学“十一五”计划和远景规划提出的建设任务，为把南京航空航天大学建设成为具有航空、航天、民航特色的、国内一流的、有广泛国际影响的高水平研究型大学而努力奋斗。
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