种蝇室的温度应控制在24℃以上(最好为30℃左右)。
蝇蛆培养室的温度应控制在20℃以上,但室温不宜超过35℃,因为高温环境加上蛆料培养基的发酵产热等因素,使得培养基中的温度过高而导致蝇卵孵化率降低,从而使蝇蛆的产量下降。
温度在24℃以下时种蝇的性腺发育可能受阻,其新陈代谢的速度也减缓,从而导致家蝇各个生态时期的发育时间延长。因此在计划养殖家蝇之前应了解当地的气温变化规律,在日平均气温低于30℃的月份,最好在简易温室内进行养殖。
春秋季节,室内稍经加温,即可达到蝇蛆养殖的适宜温度。冬季的寒冷地区因需增加保温成本,养殖蝇蛆不合算。