A、蛋白质工程通过改造基因来改造蛋白质，可以生产自然界中不存在的蛋白质，A正确；B、细胞核移植技术可以实现优良种畜的大量繁殖，B正确；C、单克隆抗体最广泛的应用是用作诊断试剂，C错误；D、转基因动物培育过程中的最后一道“工序”是胚胎移植，D正确．故选：C．
