公司按照所在城市的最低工资标准作为住房公积金的缴存基数缴纳住房公积金，如何办？

一般情况下，还真没法计较。也可以去公积金管理中心去投诉，让他们去核查，这就涉及很多取证了。这也是公司的态度问题，先跟公司沟通一下吧。关键是公司人一多，这样成本就上升了，但规定是按职工的上一年度的平均工资作为缴纳基数的。但也不是像社保一样非常地强制执行。没有说不按这样做有什么后果，像现在的一些企业在这方面做得还是不到位。只能靠政府慢慢完善这方面的制度。

各地略有不同，按当地或本部门规定缴纳。有的单位为节省缴纳金额采取最低缴纳方式，这是不合理的，可以到相关部门仲裁处理。
一般：
缴存比例,一般指住房公积金的缴存比例，就是你应缴公积金的系数,例如你的工资是100元,应缴公积金的系数是3%,那么你的应缴公积金的数额就是3元.它和你的工资基数和应缴系数都有关系,工资额和系数的增加或减少,应缴公积金的数额都会相应变化.
单位及个人的缴存比例可在5%~20%自行选择，个人缴存比例应等于或高于单位缴存比例。 　　另外，2010年1月1日后新参加工作的职工，从参加工作的第二个月开始缴存住房公积金，以其参加工作的第二个月工资总额作为缴存基数。2010年1缴存比例月1日后新调入的职工，从调入当月开始缴存住房公积金，以其调入当月工资总额作为缴存基数。