罗马全面战争里我城市太多了，管不过来怎么办？所以现在我都不敢怎么占别人的城市

首先，回答了这么多全战的问题，第一次看到有人嫌地皮多的……先耻笑一个。

首先在开局的时候就要把那个允许管理无总督城邑的选项勾上，不然就只能管理有总督的城市了。

不建议开自动管理。
一条条来说。其实管理城市没啥难的，就是调整合理税率，建设公共设施，驻军……仅此而已。
瘟疫产生的话在这游戏里完全是随机的，指不定在哪个城市就会爆发，没办法阻止，最多只能够增加卫生设施（澡堂啥的），及时扩充城市防止脏乱。但是瘟疫的传播是可以控制的。一旦某个城市发生瘟疫你就不能在这个城市调入调出部队或者事务官，否则就会感染并且传播到别的城市……当然敌方的事务官就只能拦着了。
叛乱的话就是你的问题了，想不叛乱只能增加市民的满意度……一般城市变蓝脸就已经危险了，红脸的话就有可能叛乱，就必须注意。增加市民满意度的因素有：宗教建筑，文化建筑，卫生建筑，驻军，人口增长，派驻总督的民望等等，减少市民满意度的因素有：宗教冲突，反对侵略，骚乱，瘟疫，距离首都距离，税收负担等……不同的城市有不同的情况，建议打开城市详览看看主要造成不满的因素是什么，再对症下药…………至于绿脸的城市，基本上不用怎么管理了。

你可以挑比较重要的城市占领啊，小城市没必要的哇！！！