携带起始密码子甲硫氨酸的tRNA和携带普通甲硫氨酸的tRNA是不同的,携带起始密码子的是N-甲酰甲硫氨酸tRNA,携带普通甲硫氨酸的tRNA是甲硫氨酸tRNA。
原核生物起始密码子前面有SD序列,真核有Kozak序列。真核生物是单顺反子,mRNA中第一个AUG就是起始密码子。原核可以有多个起始密码子。