企业会计与预算会计最大的区别可能是会计核算基础，企业会计按照权责发生制记账，预算会计包括财政总预算会计、行政事业单位会计大部分是按照收付实现制记账，事业单位部分业务也可以按照权责发生制核算；其次区别可能在于成本核算，预算会计一般不进行成本核算，只有个别有经营收支业务的事业单位进行简单的成本核算；再者，会计要素也有差别，企业会计要素分为资产、负债、所有者权益、收入、成本和费用、损益六类，预算会计会计要素一般分为资产、负债、净资产、收入、支出五类。
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