北科建集团的股东单位共有3个：北京市国有资产经营有限责任公司（简称“北京国资公司”）、北京城建投资发展股份有限公司（简称“城建股份”）和北京城市开发集团有限责任公司（简称“城开集团”）。其中北京国资公司为控股股东，北科建集团是北京国资公司在城市开发领域的重要平台。
