如果是比较正规的公司,用的也是专业的财务软件,那么建议你把这笔款项退回去,让对方重新打款到对公账户,再开发票,这样就可以把这笔款项做平了,否则会一直挂在账上,税务查账会有麻烦的。如果是小型的公司,不用专业的财务软件的,那就随便你了。