一期工程将于2012年底前动工,计划2015年6月底前完成,确保首批新生2015年9月进驻,余下基建任务2019年底前全部完成。学院计划从2013年开始招生,到2015年在校生规模将达1500人、专任教师和科研人员规模达到300人左右,2025年后在校生规模将稳定和达到4000人左右。届时,浙江大学海洋系将全部搬迁至舟山,并升格为浙江大学海洋学院,浙大将集全校之力,打造国际一流的浙江大学海洋学院。整个学院将设海洋生物、海洋科学、船舶建造等5个系、10个研院所。