明月孤星的故事发生在打败孤苍雁及江玉郎后的三年，由轩辕巧巧无意得知九龙旗可得天下秘宝的消息开始，武林再掀波涛、邀月再度重出武林，逐步抽丝剥茧追查幕后的无名黑手，却发现邀月气绝身亡……剧情紧凑，绝无冷场。明月孤星资料片必需接续正式版中的破关存档，所有的数值及装备将完全的继承下来。另外必需注意的是，如果您的若湖或仇心柳在江玉郎一役中不幸死亡的话，这种关系也会因此而继承下来，永远不会再出现了……
