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你说的情况不是互碰自赔，你追尾，属全责。应是无责代赔。
互碰自赔是指：事故中双方都有责任，各车损失分别不超过2000元，经过事故方协商同意，可以采用互碰自赔，即自己的车损由自己的交强险公司赔付。
无责代赔：双方都为投保交强的机动车，一方全责一方无责，应由无责方赔付有责方的100以内损失，实际由有责方的交强保险公司代赔。
比如：你全责，对方车损540，你的车损200，则由你的交强险公司赔付540+100=640，你的车损余下的100由你的商业车损险公司赔付。
所以，如果三者损失保险公司定损也为540的话，你的损失也超100的话，修理厂代索赔应向交强公司索赔640元。540给你，100付你的车辆修理费。
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