病毒分析已经发现100种类型的人乳头状瘤病。其中16、18、31、33、35、45型则具有高危险性，人乳头状瘤病毒至少引起人类10余种疾病。常见的为寻常疣。它还可引起多种性传播疾病，其中最主要的为尖锐湿疣。某些类型的人乳头状瘤病毒还与生殖道恶性病变的发生有关，如子宫颈癌、肛门癌、阴道癌和阴茎癌，其中以子宫颈癌威胁最大。
