港口在清末发展成圩，因为是石岐通往广州必经的重要港口，所以得名“港口”。1949年，为港口乡，属中山县一区。1958年，港口乡成立人民公社。1979年称港口人民公社，辖19个生产大队。1983年11月称港口区，辖于中山县，原生产大队改为乡。1986年12月改为港口镇，镇政府驻东大长堤。1988年，中山市升为地级市，港口镇成为中山市辖镇。
