1、严格控制进水水质，保证装置在符合进水指标要求的水质条件下进行，进水水质不符合要求，极容易造成反渗透膜的污堵，使得水处理配件耗材很快失效，严重影响出水水质。
2、反渗透的总进水量由RO进水调节阀来控制，如果反渗透进水量没有变化，则不要乱动RO进水调节阀，严禁全开或全闭。RO浓排调节阀用来调整系统回收率，如回收率没有变化，则不要乱动浓排调节阀，绝对禁止全开或全闭。
3、装置不能长时间停运，每天于少运行2小时，如准备停机72小时以上，应用化学清洗纯净水生产设备向组件内充装1%严硫酸氢纳和18%甘油实施保护。
4、反渗透装置每次停机后启动都应让装置在进水压力小0.4Mpa条件下冲洗10分钟。
5、操作压力控制，应在满足产水量与水质的前提下，取尽量低的压力值，这样有利于降低膜的水通量衰减，减少膜的更换率。
6、操作工应在每小时对运行参数进行记录，检测纯水设备的使用情况和出水水质。主要记录内容应包括：进水，PH值，电导率，压力，SDI，水温。产水：电导率，流量，PH值，浓水：流量，压力以及各段进水压力。
7、当反渗透装置发生高低压报警时，先检查保安过滤器至高压泵这间的手动阀开度是否太小，然后检查RO进水调节阀及浓排阀是否正常，再按高低压报警复位按钮，重新启动设备。
8、进水温度控制，应根据实际用水量，取临界压力(进水压力低于该值脱盐率产生明显下降的压力值)不能满足产水与水质要求的最低温度作为该时间段内的进水温度，这样可以降低分膜水量的衰减。