为什么小鼠2号染色体miRNA最多

算目前在不同物种中发现的miRNA长度大多为22nt ,其中21～23nt 长度的miRNA占大多数,约为84%.miRNA的一个特点是它的前体常形成分子内茎环结构,而且含有大量的G:U碱基对,这个前体物经过核酸酶的加工形成成熟的miRNA[19-21]. 同线虫的lin-4和let-7一样,大部分miRNA基因与已注释基因相距较远,提示他们来自独立的转录单位.然而,相当多的分子来自pre-mRNA中的内含子.这些miRNA常与预期的mRNA以同一方向排列,提示这些miRNA并没有自己的启动子.这种组织形式为miRNA与蛋白的共同表达提供了便利的机制,同时也解释了miRNA与宿主mRNA之间的保守关系[2-24]. 然而近来研究表明,大多数哺乳动物的miRNA位于转录单元（TU）内.通过即时更新的基因组装配以及EST数据库,人们发现许多以前位于基因间隔区的miRNA位于内含子中.有时候由于选择性剪接方式,miRNA位于同一个pre-mRNA的外显子或者是内含子中.根据miRNA基因组位置,miRNA可以分为下列几种：1、位于编码蛋白质转录单元的内含子中；2、位于非编码转录单元的内含子中；3、位于基因间隔区中.混合miRNA依据剪接模式的不同而成为以上一种基因组织形式.一些内含子miRNA的位置在许多物种中是非常保守的[3-8]. 另外一些miRNA基因在基因组中和表达模式中成簇排列,意味着它们的转录以多顺反子形式的原初转录本进行（图1.1）.在人类基因组中大约50%的已知miRNA成簇表达,而且一个簇的miRNA经常是彼此相关的.而一个簇中也包含了不相关的miRNA[13-15]. 目前有研究发现,miRNA基因可能也来自于进化过程中出现的假基因.在人的miRNA基因中,miR-220和miR-492各自位于一个加工的假基因中.这说明miRNA在进化过程中可能出现了重复以及发生了变异,同时也表明了有一部分miRNA是来自于假基因中[14-28].几乎所有已经鉴定的miRNA在相近的动物中保守,如人与小鼠,以及秀丽线虫和布氏线虫.许多miRNA在动物中具有更为广泛的保守关系.例如,近三分之一的线虫miRNA可以很容易在人的miRNA中找到同源物[3-8].如果比较更远一点的物种,相当多的基因家族的扩大或缩小非常明显,最令人吃惊的例子是let-7家族,它在线虫中有四个相同的成员,在人中至少有15个,但在果蝇中只有一个[7-22]. 与植物miRNA前体相比,动物miRNA前体分子的长度变化较小,大多数在70-80nt之间.一部分miRNA常以单拷贝形式存在于基因组中.一些miRNA的前体分子常以两个或多个拷贝存在于不同染色体或者是同一染色体不同的位置上.某些miRNA来自两个或多个仅有微小差异的前体[2-7].