红斑狼疮的确切病因迄今未明，但许多的研究认为与遗传因素、内分泌（雌激素水平）、和外部感染、环境、某些药物等多种因素有关。 首先遗传易感性在系统性红斑狼疮的发病中起着重要的作用。在有该病史的家族中，直系家属的发病率为5-12％，异卵孪生的发病率为2-9％，同卵孪生中发病率高达23-69％。
